Крупнейшей работой, осуществленной Томоном в Петербурге, стало здание Биржи на Стрелке Васильевского острова. Ключевое положение будущей постройки в административном и торговом центре столицы побудило архитектора задумать целый ансамбль, с насыпной полукруглой площадью перед главным восточным фасадом Биржи, фланкированной двумя ростральными колоннами. Вместе с Петропавловской крепостью и Адмиралтейством, Биржа придала завершенность одной из самых эффектных панорам Петербурга. Само здание, решенное в форме периптера, приподнятого на высокий подиум с лестницами и пандусами, следовало формам пестумских храмов — одного из главных эстетических ориентиров эпохи. Строительство Биржи продолжалось с 1804 по 1816 гг.